無菌室總體要求：無菌室空氣凈化級別為10萬級，整體布局應合理，使用操作方便，各功能間分區(qū)明確，能夠滿足實驗室認證認可的要求。
緩沖間內的設施布置要求：緩沖間包括一級緩沖和二級緩沖，一級緩沖掛衣裝置能滿足將普通工作服與實驗室工作服分開掛放的要求，一個更鞋柜。二級緩沖內應設一洗手池（建議600*450㎜，配備自動感應水龍頭），下方不帶柜體，做到不留死角，以便于清洗。
其他部分建筑要求：為了保證無菌室的四周維護、吊頂和地面等平整、防滑、無縫隙、易清潔、不滲水、耐化學品和消毒劑的腐蝕，對建筑的其他部分提出一些特殊要求：
1、四周圍護結構：圍護結構的外圍墻體應有適應的抗震和防火能力。隔斷墻采用厚度50㎜的夾芯彩鋼板，兩側為0.476㎜厚灰白色阻燃型聚苯乙烯彩鋼板。中間泡沫容重為16㎏/m3,單面15g覆膜�？蚣苤鶓捎貌输摪逖b飾。彩鋼板陰陽角應采用鋁合金型材裝飾，其中鋁合金圓弧及底板的規(guī)格為R＝45，非彩鋼板墻面采用乳膠漆：天花板、地板、墻面的交角均為圓弧形且可靠密封。
2、吊頂：采用總厚度50㎜的夾芯彩鋼板，兩側為0.476㎜厚來白色阻燃型聚苯乙烯彩鋼板，中間夾芯層泡沫的容重為16㎏/m3，單面15g覆膜。高度統(tǒng)一為2.4±0.2m。
3、地面：鋪設3㎜厚的環(huán)氧自流坪地面（綠色）。所有地面不應留地漏，所有出入口處應采用防止節(jié)肢動物和嚙齒動物進入的設計。
4、門及窗戶：內走廊處一級緩沖、一級緩沖與二級緩沖之間的門采用鋁合金推拉門，二級緩沖與無菌區(qū)之間的門均為彩鋼板密閉單開門。無菌區(qū)與中央臺之間的彩鋼隔墻上應分別設一扇鋁合金密閉可視窗（1300*1100㎜）、一個或兩個全不銹鋼連鎖傳遞窗（600*600*600㎜），傳遞窗雙門不能同時處于開啟狀態(tài)，傳遞窗內應設紫外消毒裝置。
無菌室空氣凈化工程是屬于生物凈化工程的一種，一般無菌室要求的潔凈度為萬級，標準的微生物檢測實驗室都會專門開辟5~8個平方出來建造無菌室，無菌室只要夠放置實驗室樣品及必需的設備即可，面積無需過大而造成浪費，面積過大對于做無菌室空氣凈化工程來說不僅僅是提高建造成本而已，日后的運行及維護費用也會高的令人驚訝。一般微生物檢測按照實驗室行業(yè)要求都需要在無菌室中進行，很多食品菌、微生物等都是在超凈工作臺中完成檢測和化驗的。
隨著社會科技發(fā)展，國家越來越重視食品安全問題，無菌室空氣凈化工程也在不斷的普及。有了無菌室凈化工程，將超凈工作臺放置于無菌室內操作，使實驗環(huán)境更加潔凈，實驗樣品不易于被污染。 無菌室內配置了百級超凈工作臺也并不是所有細菌都可以進行實驗的，一般常規(guī)的菌落總數、微生物培養(yǎng)、血細胞培養(yǎng)、研究、干細胞研究、大腸菌等實驗可以在百級超凈臺進行。但是如果需要做致病細菌，為了達到保護實驗室人員的安全問題，就必須得建造生物安全實驗室，使用生物安全柜進行實驗。該類實驗不能在普通的無菌實驗室中進行。
無菌室外源性污染源，主要是通過門和無菌室內外通道侵入的室外空氣。因此無菌室的布置通常都采用按照工藝操作的關鍵程度，潔凈度的高低由里往外逐級減弱，抵御室外污染空氣的侵入。同時為物料和人員進出無菌室設置相應的控制措施，例如物料的氣閘、人員的無菌更衣系統(tǒng)以及室內廢棄物傳遞出來的通道等。無菌室內的污染源，主要來自于無菌室內必要的操作人員和部分工藝設備，通常無菌室內操作人員的四周區(qū)域是潔凈度最差的區(qū)域，也是無菌技術中重要的控制內容。
在無菌室的設計中，通過向室內輸送定量的潔凈空氣，稀釋置換室內已使用過的潔凈空氣，將臟空氣排出室外，使室內的空氣潔凈度等級達到100000級、10000級或局部達到100級的空氣潔凈度要求，室內已使用過的臟空氣由清潔的空氣取代，在空氣的稀釋置換設計中，臟空氣與清潔空氣持續(xù)地混合稀釋，逐漸減少房間中的微粒負荷。置換稀釋設計對潔凈區(qū)域的空氣凈化系統(tǒng)的設計有很高的要求，而且必須考慮無菌室的布局和操作方式，還要為關鍵區(qū)間提供合適的局部單向空氣流動保護，需要注意與空氣凈化系統(tǒng)供應的空氣一樣，滿布高效空氣過濾器的單向流動罩產生的空氣流動也可以置換稀釋房間中空氣傳播的微粒，這種空氣流動會增加有效的房間空氣交換率，并有助于污染空氣置換稀釋。無菌室內空氣置換稀釋污染系統(tǒng)設計時應注意：潔凈空氣供應的體積應足以抵消空間中不斷產生的微粒數，以此維持工藝操作的基本條件要求；室內空間供應的空氣應比普通維持條件下空氣更清潔；要求混合供應的清潔空氣應滿足去除房間內含有微粒的空氣，以達到室內空氣置換稀釋的作用。
無菌室內天花板應與風管、管道、燈具、風口等的安裝脫開，光滑、無裂縫，易于清洗。無菌室的門窗材料應選擇耐受性好、自然變形小、制造誤差小、容易控制縫隙、氣密性好的材料，最好采用雙層中空玻璃結構的雙層窗，既節(jié)約空間、又節(jié)約能源，還可以避免玻璃窗結露引起霉變，造成污染；窗盡量采用大玻璃，這樣可減少積灰點，又有利于清潔工作。